Ученые выяснили, как ковид меняет экспрессию генов в носоглотке
Биоинформатики Московского физико-технического института и Университета Салерно в Италии собрали полный набор данных экспрессии РНК в клетках носоглотки пациентов, переболевших COVID-19. Результаты исследования ученых опубликованы в журнале Scientific Data.
«Мы
пытались выяснить, как инфекция отражалась на экспрессии генов человеческих
тканей носоглотки и как отличаются между собой различные волны инфекции. Всего
отличительных черт было найдено много, сотни и тысячи, и мы каталогизировали их
в базе данных, которую опубликовали в этой статье. Это первичные
экспериментальные данные, которые каждый ученый может использовать для будущих
исследований вируса», — рассказал Антон Буздин, заведующий лабораторией
трансляционной геномной биоинформатики МФТИ.
При заражении вирусом у разных групп пациентов наблюдались различные симптомы и
осложнения — такой широкий диапазон восприимчивости к заболеванию и исходов
может быть объяснен изменением экспрессии генов, процесса, в ходе которого
наследственная информация от гена преобразуется в РНК или белок.
Патоген проникает в клетки человека через ангиотензинпревращающий фермент-2
(ACE2), расположенный на поверхности различных типов клеток. Попав внутрь, вирус
подавляет экспрессию генов клетки-хозяина. При обнаружении вируса клетки
человека активируют внутренние механизмы противодействия инфекции, что ведет к
значительному изменению их собственного транскриптома (то есть к изменению
содержания молекул РНК, образующихся в результате работы генов).
Понимание того, как меняется экспрессия генов после заражения возбудителем
COVID-19, конвертируется в знание о том, как организм реагирует на патоген на
клеточном уровне.
Анализ выявил сильное влияние инфекции COVID-19 на модуляцию
транскриптов-мишеней в клетках и показал их участие в биологических механизмах,
связанных с клеточным иммунным ответом и путем патогенеза коронавируса.
Собранный набор данных дает возможность исследовать потенциальные различия в
профилях транскриптома между разными вирусными штаммами. Это может помочь в
понимании патогенеза заболевания и потенциальных различий в путях передачи среди
различных вариантов SARS-CoV-2.
Источник: remedium.ru