Генетическое разнообразие влияет на разнородность количества лейкоцитов
Этническая разнородность количества лейкоцитов зависит от различных генетических вариантов, согласно результатам 3 больших геномных исследований ассоциаций (GWAS), опубликованных он- лайн в «Public Library of Science» от 30 июня.
Отдельные исследования количества лейкоцитов, проведенные у 14 792 японцев, 16
388 афроамериканцев, и 19 509 белых участниках, так же как в дополнительных
когортах, обнаружили некоторые генетические варианты, затрагивающие общее
количество лейкоцитов, и влияющие на некоторые подтипы лейкоцитов, такие как
лимфоциты, нейтрофилы, базофилы, эозинофилы или моноциты.
Японское исследование обнаружило 9 GWAS-существенных ассоциаций между
генетическими локусами и количеством лейкоцитов, и подтвердило 3 локуса, уже
известные, как влияющие на количество лейкоцитов. Недавно идентифицированные
локусы включают CDK6, затрагивающий количество нейтрофилов; STXBP6, ITGA4, и
MLZE локусы и область главного комплекса гистосовместимости, влияющие на
количество моноцитов; и ERG, NAALAD2, GATA2, и SLC45A3-NUCKS1 локусы,
затрагивающие количество базофилов.
Ранее определенными локусами были PSMD3-CSF3 (нейтрофилы) и HBS1L-MYB
(эозинофилы); GATA2, влияющий на количество эозинофилов, так же как и количество
базофилов; и область главного комплекса гистосовместимости, которая значительно
затрагивает эозинофилы, так же как и моноциты.
Сравнивая японскую популяцию с белой, варианты во всех 12 локусах показали те же
самые направленные эффекты, и 4 локуса (ITGA4 для моноцитов, GATA2 для
эозинофилов и базофилов, и PSMD3-CSF3 для нейтрофилов) показали
GWAS-значительную ассоциацию.
Особенно интересным было то, что ITGA4 кодирует для веществ, которые опосредуют
миграцию лейкоцитов, STXBP6 вовлечен в процесс мембранного сплава, включая
фагоцитоз, и GATA2 играет роль в гематопоэзе, особенно базофилов и эозинофилов.
Это исследование не обнаружило существенных генетических ассоциаций с
количеством лимфоцитов.
Черное популяционное исследование состояло из 7 когорт «Continental Origins and
Genetic Epidemiology Network». Авторы объяснили, что общее количество
лейкоцитов, и количество нейтрофилов в частности типично – от 10 %до 20% ниже у
афроамериканцев, чем у представителей белой расы. Это различие было приписано
варианту DARC , часто встречающемуся в Африке, которая обеспечивает селективное
преимущество в малярийных областях и влияет на продукцию и перемещение
нейтрофилов.
Мягкая нейтропения, определенная как абсолютное количество нейтрофилов меньше
чем 1,56 × 109 клеток/л в повторных случаях, найдена в 40 % популяций
африканского происхождения, и приблизительно 5 % афроамериканцев африканского
происхождения, живущих в Америке, но меньше чем у 1 % белых американцев
европейского происхождения. Авторы предполагают, что характеристика вариантов,
связанных с количеством лейкоцитов и нейтрофилов, может «помочь в клинических
подходах к связанной с раком нейтропенией или гематопоэтической мобилизации
стволовых клеток».
Исследование идентифицировало дополнительную генетическую область, которая
значительно влияет на количество лейкоцитов: вариант в CXCL2 кодирует цитокин,
затрагивающего полиморфноядерные лейкоциты (нейтрофилы, эозинофилы, базофилы).
Эта ассоциация была идентифицирована у выходцев из Латинской Америки, а также в
белых и японских популяциях.
Исследуя локусы, идентифицированные в японском популяционном исследовании и
белом популяционном исследовании, черное популяционное исследование также
подтвердило влияние CDK6 и области PSMD3-CSF3. Таким образом, в дополнение к
DARC, у 3 областей, как в настоящее время известно, есть GWAS-существенные
ассоциации с количеством лейкоцитов в черных популяциях.
Третье исследование на белых нашло множество локусов, имеющих GWAS-существенную
ассоциацию с количеством лейкоцитов. Данные более чем 19 000 людей были
проанализированы в стадии открытия, и еще 11 823 в дублировании, обнаружив, что
10 областей, значительно ассоциируются с общим количеством лейкоцитов, и 5 с
определенными подтипами лейкоцитов, были «распространены через семь геномных
локусов». Только 3 из этих ассоциаций были ранее известны.
Это исследование идентифицировало много локусов в области, а не как определенные
гены; например, места, связанные с полным количеством лейкоцитов были «6p21 в
области HLA, 17q21 около ORMDL3, и CSF3». Во всех 10 областях гены в пределах
100 КБ самого существенного варианта были потенциальными кандидатами. Особенно,
ассоциации были обнаружены около ORMDL3 и CSF3 для полного количества лейкоцитов
и количества нейтрофилов. Варианты генов-кандидатов в нескольких из этих локусов
(ITGA4, GATA2, и область MHC на хромосоме 6, который содержит связанные с
лимфоцитами гены HLA) также значительно ассоциировались с количеством лейкоцитов
и/или их подтипов в японском исследовании.
Новые результаты должны «поспособствовать нашему пониманию генетических
факторов, лежащих в основе изменения количества лейкоцитов в пределах и между
популяциями, и выдвинут на первый план важность общих генетических вариантов в
геномных областях, кодирующих хемокиновые лиганды и рецепторы к регулированию
миелопоэза, и количества циркулирующих лейкоцитов в человеческих популяциях», -
пишут авторы черного исследования.
Источник: Abbottgrowth.ru