Компания Sequoia genetics ГК Алкор Био установила и успешно запустила систему полупроводникового секвенирования ДНК
На базе молекулярно-генетической лаборатории компании Sequoia genetics, входящей в Группу компаний Алкор Био и являющейся резидентом Сколково, успешно установлено и запущено оборудование для проведения полупроводникового NGS секвенирования (метод прямого «прочтения» молекулы ДНК).
Данный запуск является первым в Санкт-Петербурге и одним из 10 для Российской
Федерации. Платформа Ion PGM (Life technologies) была выбрана среди прочих
доступных решений в связи с наличием возможности легкого изменения
производительности системы путем замены чипа, доступной цене секвенирования и
постоянно высокой активности производителя в области улучшения аналитических
свойств системы. Первый тестовый раунд секвенирования и последующий анализ
полученных результатов показал неплохие результаты по общему объему прочтения и
покрытию. Также были выявлены проблемы, свойственные полупроводниковому
секвенированию – значительные погрешности в «чтении» гомополимерных участков. По
утверждению производителя эти проблемы уже частично решены за счет улучшения
качества реагентов.
Оборудование будет использовано в рамках Проекта по созданию диагностического
решения для выявления тяжелых наследственных заболеваний у новорожденных и их
носительства у пар, планирующих беременность. Предлагаемый подход позволит
существенно улучшить информативность проводимых исследований и, соответственно,
повысить их качество. Проект реализуется при участии компании Химэксперт и
поддержке корпорации Life technologies.