Ученые собрали геном возбудителя иммунодефицитной пневмонии
Секвенирование генома дрожжеподобного гриба Pneumocystis jirovecii - это достижение, которое поможет идентифицировать новые лекарственные мишени для лечения и предупреждения пневмоцистной пневмонии, распространенной и зачастую смертельной инфекции для пациентов с иммунодефицитом, сообщает EurekAlert!.
Этот микроорганизм не может быть выделен и культивирован в лабораторных условиях
для исследований, следовательно, особенности его биологии и патогенности до сих
пор были практически неизвестны. Геномная последовательность P. jirovecii
предоставила ученым сведения, необходимые для разработки терапевтической
стратегии.
Пневмоцистная пневмония относится к оппортунистическим инфекциям, поражающим
людей с нарушенной иммунной системой. Особую важность она приобрела в 1980-х - с
увеличением числа больных с синдромом приобретенного иммунодефицита.
Для получения генома возбудителя пневмоцистной пневмонии авторы исследования,
группа ученых под руководством Филиппе Хаузера (PhilippeHauser) из Госпитального
центра Университета Вадуа и Университета Лозанны, Швейцария, взяли образцы
бронхоальвеолярного смыва у пациентов с пневмоцистной пневмонией,
концентрировали клетки гриба иммунопреципитацией и умножили копии ДНК,
выделенные из этого материала, методом амплификации. Полученная ДНК представляла
собой смесь полинуклеотидных цепочек молекулы наследственности самого гриба,
человека и других микробов, обитающих в легких пациента.
Просеквенировав суммарную ДНК, экспериментаторы передали ее биоинформатикам,
которые проанализировали последовательности нуклеотидов и выделили из них те,
что принадлежали дрожжеподобному грибу- возбудителю пневмонии. После этого
отдельные фрагменты ДНК патогенна были собраны в геном, являющийся по сути
метагеномом, то есть совокупным геномом генетического материала дрожжеподобного
гриба из образцов среды.
Анализ полученного генома возбудителя пневмоцистной пневмонии показал, что этот
микроб не способен производить токсины и факторы вирулентности, которые
содействуют проникновению микроба в организм хозяина. Этим объясняется тот факт,
что P. jirovecii не вызывает заболевания у здоровых людей, но выходит из-под
контроля, не встречая сопротивления иммунной системы.
В настоящее время пневмоцистную пневмонию лечат препаратами-антагонистами
фолиевой кислоты, которые ингибируют дигидрофолат редуктазу (DHFR), фермент,
участвующий в синтезе нуклеотидов. Ингибирование этого фермента блокирует синтез
нуклеотидов, что в свою очередь препятствует репликации ДНК и клеточному
делению.
Однако многие изоляты микроба показывают приобретенную устойчивость к
антифолатам, что делает поиск новых мишеней лекарственной терапии актуальной
исследовательской задачей.
Результаты исследования опубликованы в онлайновом издании Американского
Микробиологического Общества mBio и доступны исследователям во всем мире.
Источник: Medportal.ru