Главная    Реклама  

  MedLinks.ru - Вся медицина в Интернет

Логин    Пароль   
Поиск   
  
     
 

Основные разделы

· Разделы медицины
· Библиотека
· Книги и руководства
· Рефераты
· Доски объявлений
· Психологические тесты
· Мнение МедРунета
· Биржа труда
· Почтовые рассылки
· Популярное

· Медицинские сайты
· Зарубежная медицина
· Реестр специалистов
· Медучреждения

· Новости медицины
· Новости сервера
· Пресс-релизы
· Медицинские события

· Быстрый поиск
· Расширенный поиск

· Вопросы доктору
· Гостевая книга
· Чат

· Рекламные услуги
· Публикации
· Экспорт информации
· Для медицинских сайтов


Объявления
 

Статистика


Статьи / Фундаментальная медицина | Опубликовано 04-11-2002
Размер шрифта: 12px | 16px | 20px

Фундаментальная медицина
Данная информация предназначена для специалистов в области здравоохранения и фармацевтики. Пациенты не должны использовать эту информацию в качестве медицинских советов или рекомендаций.


Объемное знание – 2. Виртуальный признак в биологии и медицине

Нечмирёв Андрей Борисович

Математический анализ признаков значительно повышает полноту использования информации, а анализ комплекса показателей не только суммирует дифференцирующие способности признаков, но и выявляет новые дополнительные возможности распознавания, не содержащиеся ни в одном отдельном признаке [1].

В настоящей работе сделана попытка выявить дополнительные возможности распознавания при анализе совокупности признаков, учитываемых в микробиологии, с целью получения диагностической информации в ее количественном выражении, не содержащейся ни в одном из признаков в отдельности.

Можно сказать, что в основе распознавания микроорганизмов лежит различие в связи между признаками и дифференцируемыми группами. Чем чаще признак определяется у одной из групп, и чем реже у другой, тем больше диагностическая информация от обнаружения у штамма этих градаций признака.

Количественно такая информация может описываться десятичным логарифмом отношения вероятностей выявления градаций признака в дифференцируемых группах, умноженным на 10 – так называемым диагностическим коэффициентом (ДК) [2,4]. При выявлении у исследуемого штамма градации «+» признака «1», которая встречается у представителей группы «А» с частотой Pa, а у представителей группы «В» с частотой Pb, будет получена диагностическая информация в количестве: ДК+1=10lg(P+a / P+b).

При выявлении градации «-»: ДК-1=10lg(P-a / P-b).

Знак «+», который может иметь вычисленный диагностический коэффициент, свидетельствует о преобладании вероятности того, что штамм относится к группе, частота которой находится в числителе отношения. ДК со знаком «-» указывает на преобладание вероятности альтернативной группы.

При получении информации по результатам нескольких тестов вычисленные ДК алгебраически складываются.

Любому значению ДК или их сумме соответствует определенная вероятность (Р) принадлежности штамма к той или иной дифференцируемой группе. Эта вероятность может быть найдена по таблицам [2] или по формуле, выведенной нами из формул [2], отражающих взаимосвязь ДК и Р:

Р = (alg0,1ДК-1)/((alg0,1ДК-1)/ (alg0,1ДК)) [Формула 1].

Представим себе совокупность из двух бинарных, то есть имеющих только градации «+» и «-» признаков как единство, более сложное, по отношению к его составляющим. Градациями такого признака-комплекса будут все возможные сочетания градаций его составляющих: «++», «--», «+-», «-+». Обозначим их частоты по отношению к дифференцируемым группам и признакам, и определим несомую ими диагностическую (дифференцирующую образы) информацию так, как это показано в таблице 1, и назовем ее V-информацией, в отличие от ДК-информации. ДК-информация тождественна V-информации и их значения могут алгебраически складываться.

Таблица 1. Определение величины V-информации градаций признака-комплекса

Вероятность градаций в группах

Формулы, для вычисления величины V-информации

А

В

P++a1,2

P++b1,2

V++ = 10lg(P++a1,2/ P++b1,2)

P--a1,2

P--b1,2

V-- = 10lg(P--a1,2/ P--b1,2)

P+-a1,2

P+-b1,2

V+- = 10lg(P+-a1,2/ P+-b1,2)

P-+a1,2

P-+b1,2

V-+ = 10lg(P-+a1,2/ P-+b1,2)

1

1

 

Благодаря получению V-информации при помощи одних и тех же признаков к информации о различии в связи между признаками и дифференцируемыми группами прибавляется порция информации о различии в связи между признаками у этих групп. V-информация представляется нам достаточно независимой от ДК-информации (то есть не дублирует ее).

В этой связи, даже среди наименее перспективных в отношении ДК-информации признаков можно найти такие, которые дадут значимую V-информацию. К примеру, показано [3], что тесты на рафинозу (тест 1) и рамнозу (тест 2) у представителей Esherihia (группа А) и Shigella (группа В) дают положительный и отрицательный результат с частотой 0,5, то есть P+a1 = P+a2 = P+b1 = P+b2 = P-a1 = P-a2 = P-b1 = P-b2 = 0,5. Если нет иной информации, то справедливо сделать заключение о непригодности этих тестов для дифференциации указанных групп. При подсчете окажется, что все ДК = 0.

Гипотеза. Теперь предположим, что получена дополнительная информация о достоверном различии в скоррелированности одних и тех же сочетаний градаций признаков у дифференцируемых групп. Сочетания градаций «элементарных» признаков выступают здесь как градации признака-комплекса. Обозначим их в буквенном выражении (таблица 2) и дадим им произвольные числовые значения, соблюдая вышеуказанное равенство – все ДК = 0.

Таблица 2. Частота градаций V-признака у дифференцируемых групп

   

Esherihia (группа А)

Shigella (группа В)

Рамноза (тест 2)

+

-

 

+

-

 

Рафиноза (тест 1)

+

P++a1,2

0,1

P+-a1,2

0,4

P+a1 = 0,5

P++b1,2

0*(0,01)

P+-b1,2

0,5

P+b1 = 0,5

-

P-+a1,2

0,4

P--a1,2

0,1

P-a1 = 0,5

P-+b1,2

0,5

P--b1,2

0*(0,01)

P-b1 = 0,5

   

P+a2 = 0,5

P-a2 = 0,5

 

P+b2 = 0,5

P-b2 = 0,5

 

* Примечание: Для исправления нулевых частот использована формула [2]: P = 1/(n + a), где P – исправленная частота (в таблице дана в скобках); n – общее число штаммов в группе (здесь условно взято100); а – число градаций признака (здесь 2).

Вычисляя величину V-информации по формулам таблицы 1 получим: V++ = V-- = 10; V+- = V-+ = -1.

По формуле 1 вычислим, что значениям V = 10, тождественным ДК, соответствует вероятность Р = 0,91, имеющая значение в медицинских научных исследованиях [7], свидетельствующая о преобладании вероятности группы А. Прочим градациям виртуального признака соответствует Р = 0,44, указывающая на преобладание вероятности группы В.

Таким образом, теоретически показана возможность получения диагностической информации, не содержащейся ни в одном из отдельно взятых признаков. До настоящего времени информация подобного рода в ее количественной мере в микробиологии не использовалась и фактически была потеряна для исследователя.

Практика. Для нахождения V-информации на основе реальных данных мы взяли признак-комплекс арабиноза-рамноза для дифференциации Salmonella typhimurium от Shigella flexneri 1-5, x- и y-variant. Данные о наличии сочетаний признаков у биоваров дифференцируемых групп (соответственно 25 и 15 биоваров) мы взяли из таблиц 39 и 41 литературного источника [3], по ним вычислили частоты градаций V-признака: P++a1,2 = 0,68; P--a1,2 = 0,08; P+-a1,2 = 0,20; P-+a1,2 = 0,04; P++b1,2 = P--b1,2 = P+-b1,2 = 0,267; P-+b1,2 = 0,2, а затем определили, согласно формул таблицы 1: V++ = 4,1(P=0,72); V-- = -5,2(P=0,77); V+- = -1,2(P=0,43); V-+ = -7,0(P=0,17).

Таким образом, учет виртуальных признаков может внести свою лепту диагностической информации, и подчас существенную, в дело распознавания образов.

Для получения V-информации не требуется изучения дополнительных признаков – используется уже изученные признаки, от которых получали ДК-информацию.

На практике реализация виртуальных признаков может осуществляться табличными методами или с помощью ЭВМ [8]. Это сделает ее доступной для рядовых врачей. Полагаем, что более полное использование признаков, за счет извлечения V-информации позволит уменьшить число обязательных тестов в схемах распознавания. Особенно привлекательным это может оказаться при проведении весьма дорогостоящих испытаний новых лекарственных препаратов на людях.

Думается, что признаки-комплексы сами, или в сочетании с «элементарными» признаками могут являться составляющими для более интегрированных виртуальных признаков.

Вышеизложенный алгоритм может быть использован для моделирования такого свойства как интуиция, о чем будет рассказано в планируемой к публикации статье «Объемное знание –3. Интуиция».

Литература

  1. Генес В.С. Некоторые простые методы кибернетической обработки данных диагностических и физиологических исследований. М., 1967.
  2. Гублер Е.В. Вычислительные методы анализа и распознавания патологических процессов. Л., 1978.
  3. Методические указания по микробиологической диагностике заболеваний, вызываемых энтеробактериями. М., 1984.
  4. Нечмирёв А.Б.//Журн.микробиол, 1986, № 2, с.12-14.
  5. Нечмирёв А.Б. Сложный признак и его диагностическая информация в микробиологии. Депонировано в ВИНИТИ, 1989 г.
  6. Nechmirev A.B. Three fells from two sheeps. Отправлено на конкурс компьютерных программ, проводимый фирмой Hewlett Packard в Москве.
  7. Сепетлиев Д. Статистические методы в научных медицинских исследованиях. М., 1968.
  8. Демонстрационная версия программ «Распознавание» 24.09.2002, «Дифференциальная диагностика желтух» 29.09.2002. Автор Нечмирёв А.Б. Каталог мед.программ на http://www.rusmedserv.com

Информация об авторе:
Нечмирёв Андрей Борисович
Должность:
Врач-программист
Место работы:
СЭС МСО (санэпидстанция бывш.IV Главн.Управления Республики Узбекистан), Республиканский центр хирургии, Ташкентский городской центр борьбы со СПИД, ООО «Хумо» при АО УзбекКосмос
Печатный или электронный источник:
публикуется впервые.
E-mail: ses@sarkor.uz




Если вы заметили орфографическую, стилистическую или другую ошибку на этой странице, просто выделите ошибку мышью и нажмите Ctrl+Enter. Выделенный текст будет немедленно отослан редактору


 Мнение МедРунета


Почтовые рассылки сервера Medlinks.ruХотите своевременно узнавать новости медицины и быть в курсе новых поступлений медицинской библиотеки? Подпишитесь на почтовые рассылки сервера Medlinks.ru Почтовые рассылки сервера Medlinks.ru


Реклама

Фундаментальная медицина

Информация по теме
· Все по теме
· Статьи по теме
· Новости по теме
· Советы по теме
· Пресс-релизы
· Книги по теме
· Сайты по теме
· Рефераты по теме
· Дискуссии на форуме
· Медицинские события
· Вакансии и резюме
· Специалисты
· Медучреждения


Новое в разделе
1. Синхронизация часов организма может стать секретом замедления старения
2. Ученые выявили молекулярные изменения в 19 органах из-за физических упражнений
3. Как совместить работу и дополнительное образование?
4. Оценка антиокислительной активности различных соединений
5. Открытие в области регенеративной медицины: новый метод заживления ран
6. Специалисты Приволжского исследовательского медуниверситета создали первый медицинский атлас
7. Совместный проект ЯГМУ и «Р-Фарм» вошел в программу «Приоритет 2030»
8. Кто населяет тело человека? Рассказывают ученые Пермского Политеха
9. RUSSCO приняло участие в работе XIX Международной (XXVIII Всероссийской) Пироговской научной медицинской конференции
10. Ученые НИТУ МИСИС синтезировали «интеллектуальный» материал для медицины


Правила использования и правовая информация | Рекламные услуги | Ваша страница | Обратная связь |





MedLinks.Ru - Медицина в Рунете версия 4.7.19. © Медицинский сайт MedLinks.ru 2000-2024. Все права защищены.
При использовании любых материалов сайта, включая фотографии и тексты, активная ссылка на www.medlinks.ru обязательна.