В кишечной микрофлоре половины населения Земли нашли новый вирус
Биологи из Университета Сан-Диего объявили об обнаружении ранее неизвестного вируса-бактериофага, поражающего один из самых распространенных типов кишечных бактерий. Ученые полагают, что вновь открытый вирус присутствует в кишечниках у более чем половины населения Земли и может играть важную роль в развитии ожирения и диабета. 24 июля работа опубликована в онлайн-версии журнала Nature Communications.
Специалист по биоинформатике Роберт Эдвардс (Robert A. Edwards) и его коллеги
впервые выявили фрагменты ранее неизвестной вирусной ДНК длиной примерно 97
тысяч пар оснований в ходе компьютерного анализа результатов предыдущих
исследований обитающих в кишечной микрофлоре вирусов. Фрагменты были обнаружены
в фекальных образцах двенадцати не связанных между собой человек. Проведенная
затем проверка по базам данных консорциума «Микробиом человека» и MG-RAST (веб-сервер
автоматического метагеномного анализа) показала присутствие ДНК нового вируса в
большом числе образцов человеческой кишечной микробиоты.
Для подтверждения существования вируса, названного первооткрывателями crAssphage,
в реальности, авторы применили метод амплификации ДНК (искусственного увеличения
числа копий последовательности ДНК) и выявили его присутствие в исходном
биоматериале, использованном при создании базы данных консорциума «Микробиом
человека». «У нас есть биологическое доказательство того, что вирус, который мы
изначально нашли с помощью компьютера, действительно существует», - отметил один
из членов группы, вирусолог Джон Мокили (John Mokili).
Опираясь на аналогии в белковом составе ДНК crAssphage с уже описанными
вирусами, Эдвардс и его коллеги пришли к выводу, что открытый ими микроорганизм
является бактериофагом (вирусом, избирательно поражающим бактериальные клетки и
вызывающим их разрушение). Используя современные биоинформационные технологии,
ученые установили, что мишенью crAssphage является Bacteriodetes – один из самых
распространенных типов кишечных бактерий. Эти бактерии обитают в прямой кишке и,
как считается, играют ключевую роль в биологическом механизме, связывающем
развитие ожирения и диабета с составом кишечной микрофлоры. Каким образом влияет
на этот процесс crAssphage, еще предстоит выяснить, отмечают авторы.
Широкая распространенность вновь открытого вируса среди населения планеты - в
шесть раз превышающая таковую у других бактериофагов - свидетельствует о его
древности, однако тот факт, что он до сих пор «проходил под радарами», довольно
странен, считает Эдвардс.
Стоит отметить, что в последние годы появилось много научных данных,
предполагающих ключевую роль состава кишечной микрофлоры в патогенезе различных
заболеваний. Помимо ожирения и диабета, речь идет о болезни Крона, аутизме,
ревматоидном артрите, рассеянном склерозе. В начале июля биологи из Технического
университета Дании сообщили о выявлении в человеческом кишечном микробиоме свыше
полутысячи ранее неизвестных бактерий, а также около 800 новых бактериофагов.
Источник: Medportal.ru