Данная информация предназначена для специалистов в области здравоохранения и фармацевтики. Пациенты не должны использовать эту информацию в качестве медицинских советов или рекомендаций.
EPAM и Институт биоинформатики провели первый в Санкт-Петербурге хакатон BioHack
Основная цель проведения BioHack – объединить талантливых, инициативных и амбициозных профессионалов и энтузиастов в области биоинформатики для развития перспективных идей и ИТ-решений для биологии и современной медицины. Партнером мероприятия стал Университет ИТМО, на площадке которого собрались 100 лучших участников, прошедших конкурсный отбор. В состав каждой команды вошли как биологи, так и программисты.
EPAM Systems (NYSE: EPAM), ведущий глобальный поставщик услуг по разработке
программного обеспечения и технологических решений, совместно с Институтом
биоинформатики, некоммерческой организацией, занимающейся подготовкой
высококвалифицированных специалистов в области биоинформатики, провели первый в
Санкт-Петербурге международный хакатон BioHack. В течение 48 часов 24 команды
решали прикладные задачи от МФТИ, Научно-исследовательского института
биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича», Медико-генетического научного центра,
Института белка РАН, ФНКЦ физико-химической медицины, компаний iBINOM и Genotek
и других работающих в сфере биоинформатики научных центров, лабораторий и
независимых институтов. Первое место и главный приз в 100 000 рублей получила
команда проекта «Анализ демографической истории по геномным данным», в состав
которой входили магистранты Санкт-Петербургского Академического университета
РАН.
Основная цель проведения BioHack – объединить талантливых, инициативных и
амбициозных профессионалов и энтузиастов в области биоинформатики для развития
перспективных идей и ИТ-решений для биологии и современной медицины. Партнером
мероприятия стал Университет ИТМО, на площадке которого собрались 100 лучших
участников, прошедших конкурсный отбор. В состав каждой команды вошли как
биологи, так и программисты.
Сервис для анализа данных по болезни Альцгеймера, мобильное приложение для
знакомства с основами биоинформатики, предсказание сайтов посадки
транскрипционных факторов в геноме, создание программного обеспечения для
определения перинатального риска, интерактивный анализ большого объема данных
RNA-seq, микросервисы в облаке для биоинформатики - выбирать задачи для
реализации из почти 40 вынесенных на хакатон тем каждый из участников мог по
своему вкусу и компетенциями. Призерами BioHack стали команды проектов
«Исследование связанных состояний молекул воды в интерфейсах биомакромолекул» и
«Горизонтальный перенос генов бактериофагами в метагеномах». Первое место жюри
присудило проекту, в рамках которого предлагалось с помощью анализа генома
животного реконструировать демографическую историю его вида – события и их
последствия, которые сформировали геном именно таким, каким его можно наблюдать
сейчас.
Михаил Альперович, руководитель направления биоинформатики, EPAM:
Для EPAM особенно важны инициативы, стимулирующие развитие биоинформатики,
поскольку это одна из тех областей, где объединение научных знаний и потенциала
информационных технологий способно принести колоссальные результаты для сотен
миллионов людей по всему миру. BioHack позволяет молодым талантливым
специалистам и студентам проявить себя и найти решения для задач, которые
завтра, вполне возможно, изменят наше представление о медицине или
биотехнологиях. Вместе с тем это именно тот формат, который способствует
развитию отраслевого профессионального сообщества в Санкт-Петербурге. Совместно
с Институтом биоинформатики мы планируем сделать BioHack ежегодным и уже в
следующем году значительно расширить состав его участников.
Николай Вяххи, основатель и директор, Институт биоинформатики:
Мы уже не первый год проводим образовательные мероприятия в области
биоинформатики и испробовали множество форматов: годовые курсы, летние школы,
интенсивы и семинары, онлайн-программы и т.п. Хакатон уникален прежде всего тем,
что позволяет юным программистам, математикам, биологам и будущим медикам
познакомиться с биоинформатикой в коротком и интенсивном режиме, который
способствует междисциплинарному общению и взаимодействию. Опыт первого хакатона
показал, что такой формат идеально подходит для студентов, готовых работать ночи
напролет. Благодаря компании EPAM участие для них в мероприятии бесплатно, а это
позволяет нам отбирать самых мотивированных и перспективных участников, повышая
тем самым качество выполняемых проектов.